【中新社臺北5月10日電】臺灣當局領導人馬英九10日決定，同意“中研院”院長翁啟惠3月29日所提辭呈。因捲入浩鼎案，翁成為了歷史上首位遭列被告的“中研院長”。
　　臺灣當局領導人辦公室發言人陳以信當日表示，馬英九已指定秘書長曾永權與翁啟惠會面、轉達上述決定。
 　　中央社發佈了馬英九給翁啟惠信函全文。馬英九在信函中指出，近三月來社會各界及立法機構對翁啟惠疑涉浩鼎案極為關注。3月28日晚接獲翁自美打來的電話、擬以口頭方式請辭院長職務，他當即表示以越洋電話請辭如此重要職位並不相宜，應以書面提出較為妥適。3月29日複接翁傳真辭職信函，他要求對方盡速回台作相關報告後再予處理。
 　　翁啟惠4月15日自美返台，兩次與馬英九會面、兩次在台立法機構就浩鼎案提出報告並接受質詢。馬英九在信函中表示，綜觀近日相關報道，臺灣各界對翁因浩鼎案遭檢察官訊問、搜索，多持“應辭職”的看法；因此，為維護“中研院”聲譽並審酌各界期待，他決定同意翁3月29日所提辭呈。
 　　信函中還透露，翁啟惠請辭獲准後，將依通例，留任王汎森、王瑜、王惠鈞等三位副院長，並指派其中一位代理院長職務，以維持“中研院”正常運作。
 　　據臺灣媒體報道，臺灣檢方懷疑，“中研院”在翁啟惠主導下，賤賣研究技術給臺灣浩鼎生技股份有限公司，損害該院利益。翁還疑似用女兒當“人頭”，私下持有浩鼎股票，有背信之嫌。4月21日，翁因涉嫌犯貪污、背信等罪被限制出境。
　　翁啟惠指辭職將人事動盪 總統：顯係多慮
　　中央社報道：中研院長翁啟惠曾表示辭職將造成人事極大動盪，不過，總統馬英九今天在信函中說，此一考量，顯係多慮，他將指派一位副院長代理院長職務，絕不致因翁啟惠辭職造成人事動盪。
　　馬總統今天同意翁啟惠在3月29日所提辭呈，馬總統表示，為維護中研院聲譽，並在審酌各界期待後，同意准辭，並依通例指派其中一位副院長代理院長職務。
    總統府發言人陳以信今天表示，馬總統命總統府秘書長曾永權上午前往拜會翁啟惠，轉達總統已決定同意翁啟惠於3月29日所提辭呈，並轉交總統信函。
    馬總統在信函中表示，近3月來社會各界及立法院對翁啟惠疑涉浩鼎案，極為關注。3月28日晚上他接獲翁啟惠自美國來的電話，擬以口頭方式請辭中研院長職務，但他認為以越洋電話請辭如此重要職位，並不相宜，應以書面提出較為妥適。
    3月29日翁啟惠傳真辭職信函，有關請辭一事，總統在3月30日批示，「中研院為我國最高學術研究機關，其院長之進退，事關重大。請翁院長儘速回國向本人及立法院報告後再予處理，以維護中研院之聲譽並避免外界誤解」。
    4月15日翁啟惠自美返國後，先後於當日及4月25日兩次前往總統府向總統說明浩鼎案疑義。4月15日，翁啟惠就近日中研院爭議帶來困擾之處向馬總統致歉，並對馬總統關心與建議表示感謝。至於先前請辭之事，並未在會中提及。
    翁啟惠在4月18日及27日兩度赴立法院教育及文化委員會就浩鼎案提出專案報告並接受質詢，並表示，回來就是要誠實面對，「會堅守崗位到最後一分鐘」。
    4月25日，翁啟惠再度入府向馬總統報告，以一份信函說明立場，但並未向馬總統請辭。信中保證絕無內線交易，願即日起授權副院長處理中研院重要行政，並配合提前辦理交接；馬總統則說，翁啟惠的決定恐與外界期待有所落差，希望翁啟惠能再慎重考慮。
    馬總統在致翁啟惠的信函中提到，綜觀近日相關報導，各界對翁啟惠因浩鼎案遭檢察官訊問、搜索引發的進退問題，多持「應辭職」看法。他舉例，總統當選人
　　蔡英文認為「應尊重翁啟惠辭職決定」、前中研院長李遠哲公開表示「應辭職接受檢調調查」、朝野政黨均認為「應立即辭職，靜候司法調查，讓國家最高研究機關盡快回復正常運作」、立法院教育及文化委員會跨黨派立委4月27日亦共同通過提案要求「立即辭職，靜候司法調查」等。