政府為着發展旅遊，又打路環九澳村的主意，想要打造「古村遊」，不少旅遊發展委員會委員亦曾表示支持開發聖母村成為旅遊景點。但有多位於去年底曾到聖母村遊覽的市民先後反映，九澳聖母村七苦聖母堂旁邊數間正進行修復的葡式小屋，工程現場非常凌亂，擔心一些現存的歷史標記因未得到妥善保護而受到損壞，並憂慮將來如要發展成「古村遊」等旅遊項目會令聖母村的歷史消失。
有九澳居民認為，現時聖母村環境非常凌亂，「即使工程進行中亦不用那麼亂吧。」對於早前社會文化司司長譚俊榮表示有意在九澳打造「古村遊」，而不少旅遊發展委員會委員亦支持開發聖母村成為旅遊景點，居民表示對此計劃的了解甚少。「（聖母村的）工程怎批出去，我們也不知道。」「古村遊，你說『古』在哪裏﹖定義是甚麼﹖為何在這時候說這些? 這裏在發展甚麼﹖你問我有沒有意見，我們的想法又談何得上意見﹖」「一個市肺，現時堆置了甚麼﹖大家可以看到。」
有最近曾到訪聖母村的市民認為，原本幾間已荒廢的痳瘋病院小屋，有一間已經修復完成，但外表非常光鮮，失卻那種古舊感，加上對面油庫飄來陣陣油味，質疑該區是否適合成為旅遊區，同時擔心一但發展成旅遊項目，聖母村將「連歷史也煙滅」。獨立音樂人Sonia亦認為，周邊的建築也實在太大刀闊斧，沒有了原本的純樸。她坦言，是因為最近一位日本導演朋友希望拍一些澳門「很地道，沒旅客會去的地方」，於是推介並陪同到訪聖母村，但工程有種大煞風景的感覺。
「原本2010年時我與丈夫去，是由一條長長的樓梯上去，但現在因工程所有機器都在這個位置，而且有些很現代的建築已建起了，感覺都很無奈……」又指以往小屋雖然都沒有翻新，很破落，但很有澳門上世紀的感覺。「我覺得小屋的維修是好，因為之前真是很破落，但周邊的建築也實在太大刀闊斧，沒有了原本的純樸，令人覺得很惋惜……」
有分析指，早期的石屎樓房較難修補，修復如要做得專業，理應經專家論證、衡量所有可能影響建築的因素，而九澳聖母村的建築不是法定保護文物，表面上政府也可以用普通的方法去修箿，但基於其歷史及建築藝術的價值，當局也似應該謹慎處理。
就記者現場所見，聖母村現場滿地工程材料及垃圾。昔日通往碼頭的樓梯亦有水管橫躺路中。據資料顯示，九澳痳瘋病院始建於19世紀末，於1930年重建，九澳聖母村碼頭亦於同年建造。在路環公路尚未開通前，碼頭是聖母村與外界連繫的唯一途徑。而當年的碼頭碑記現只有簡單的紅白藍布包裹，石上開始長有雜草，現場亦有陣陣臭味。另外，昔日放置在聖母村入口的石樓梯上的聖母聖嬰像已不復見。據悉，聖母聖嬰像因工程關係由教會收起，暫時未知會否於工程後放回樓梯上。同時，在正修復的小屋旁邊，地上出現與小屋牆壁一樣顏色的石屎塊。
對於聖母村的修復工程，早前文化局就曾向傳媒表示，該處的小屋出現鋼筋外露、石屎爆裂等，須進行結構加固，然後再按原貌修復，甚具挑戰，但有了第一間屋的修復示範後，有信心明年可完成其餘四幢建築物的修復工作，預計每幢建築物的修復費用需逾百萬元。又表示若有條件，當局會將通往聖母村的兩條人行樓梯，包括弧形樓梯和通往碼頭的古樓梯一併修復。而文化局亦早於2013年開始修復時表示，部分小屋損壞嚴重、不具有修復條件的構件則拆除及按原樣重做。
旅遊局則表示若「九澳古村遊」要延伸至聖母村，開放予遊客參觀等，需要有不少配套方面的考慮，明年將開展片區配套的研究。當局一直有跟進開發九澳古村遊項目，但需時整合資源，做好交通配套，令旅遊元素更多、內涵更突出，才有信心推出項目，暫未有正式推出的時間表。