天順八年（1464年）七月二十日，朱見深大婚。所謂大婚，專指皇帝的婚娶。朱見深當時婚娶的吳氏，是由父親朱祁鎮選定的。吳氏聰敏知書，通曉禮樂，是一個才貌雙全的女子。據稱，由明英宗朱祁鎮選定而育於別宮的女子有三名，即吳氏、王氏和柏氏。皇帝的婚事，自然是隆重的。但是，僅僅還不到一個月，吳皇后就被廢。取而代之的是王氏，即後來的孝貞皇后。

吳氏被廢背後的緣由，一直為人所猜疑。一種說法是太監牛玉專恣，討厭太監牛玉的人想藉機奪去他的權柄，故挑動皇帝廢后。皇帝自己的說法是吳皇后「舉動輕佻，禮度率略」，且可能在冊立時牛玉有舞弊的嫌疑。然而，吳氏雖被廢，但「舞弊」的牛玉卻只是發配到南京的孝陵去種菜。迂腐的官員以為牛玉真是犯有欺君之罪，於是紛紛上疏說對牛玉的懲罰太輕。結果，朱見深將上疏的官員王徽、王淵、朱寬、李翱、李鈞貶到邊遠的州去做專管刑獄的判官。因此，「牛玉舞弊」的說法其實是不成立的。真正的原因是吳皇后得罪了皇帝寵愛的萬氏。

吳皇后對萬貴妃十分氣惱，大概是恨朱見深與萬氏的曖昧關係，最後她以後宮之主的身份杖責萬氏。皇帝獲悉此事，便毫不猶豫地廢了吳皇后。繼立的王皇后，自然從中汲取了教訓，對萬氏的態度比較友善，不大理會萬氏的橫行霸道。王皇后的明哲保身態度，以及皇帝對萬氏的寵幸，使萬氏成為成化朝後宮真正的主人。

成化四年（1468年）秋，出現了幾次彗星。在古代，彗星的出現意味著不祥。於是，大學士彭時、尚書姚夔也上疏請求皇帝要擴大寵幸的範圍，以廣後嗣。皇帝表面上同意，但行動中仍然專幸萬氏。所以，萬氏在宮中越發地驕橫起來。太監中誰違背了她的意思，就立即被趕出宮去。宮中的婦女一旦誰與皇帝發生關係並且懷孕的話，就千方百計命人進藥湯，使其墮胎。賢妃柏氏生下一子，即悼恭太子，也為萬氏所害。後來的明孝宗，若不是宮中的宮女、太監、廢后吳氏、周太后的百般保全，恐怕也遭了萬貴妃的毒手。但是，即使這樣，憲宗朱見深對於萬氏一直非常有感情。成化二十三年（1487年）春，萬氏暴病身亡。憲宗非常傷感，哀歎說：「萬氏長去了，我亦將去矣！」輟朝七天，謚萬氏為恭肅端慎榮靖皇貴妃。