澳門航空的專營權去年十一月八日屆滿之前，特區政府批准將有關專營權續期三年。續期三年的理由是：由於全球爆發新冠病毒肺炎疫情，預期本澳航空運輸業需要較長時間才能逐漸復甦；在此期間，須維持本澳航空運輸業的整體穩定。澳航的專營權延續三年，是基於新冠肺炎疫情尚未結束，全球民航業受到頗大影響，特區難以按照原計劃「開放天空」。不過合同摘錄又同時顯示，若在續期三年期間，本澳出現航空運輸業務的新競爭性經營制度，澳航獲得的續約期只會延長至新制度生效日。
去年春節前後，一場毫無預警的疫情突然襲擊了中國，新型冠狀病毒迅速擴散，全球各地的航空公司相繼宣佈暫停或減少國際航線航班。如今將近一年過去了，只有中國內地和澳門地區成功遏抑住疫情，新冠病毒仍在世界各國蔓延。隨著亞洲區新冠肺炎疫情緩和，各地政府逐步放寬經濟活動及出入境措施，包括澳門在內的區內航空公司正逐步恢復航班，成為推動旅遊業復甦的一支有生力量。這場新冠疫情的嚴重性是史無前例的，民航業所遭受的打擊也相當之沉重，短期內無法復甦。在這樣的大環境下，澳門航空若是結束專營，恐怕不容易物色到更合適的航空企業加盟澳門。所以，政府只能將澳航專營權延續三年。
當然，如果三年內民航業復甦情況理想，也不排除可在三年內引入新的競爭者，這一點比較靈活。現在我們看到，最早面對新冠疫情的中國反應最快，應對措施果斷得力，去年成為世界主要經濟體唯一保持正增長的國家。澳門特區應對疫情得力，政府正與業界攜手推動恢復旅遊經濟。由於國內所有地區均被列為低風險地區，澳門的疫情持續和緩，全國公安機關出入境管理部門於九月二十三日全面恢復辦理內地居民赴澳門旅遊簽註。在此大環境下，澳門國際機場與相關當局共同商討恢復理內地居民赴澳門旅遊簽註後的航班和旅客管理安排，根據特區政府和國際民航組織的衛生指引，在機場做好分流和物理分隔措施，儘量分開從比較高風險地區來澳的旅客。
民航界人士認為，從本澳未來航空業總體規劃上看，延長澳航航線專營權三年，期間政府有很多工作要安排處理。在二○二一年年中以前，政府需抓緊現有時間做好專營權修訂條例的相關工作，讓市場知悉法律修訂後的航空開放政策措施，才可令有興趣投資者積極投入市場申請及審批工作。此外，相關的法律修訂工作亦需時討論及研究，希望政府在研究修法過程中，更多諮詢專業團體及社會人士意見，充分收集各界聲音，全面研究航線專營權開放後，如何紓緩澳門的空域資源緊張問題，以至在大灣區航空合作上是否有新的模式及特點。這些都是未來這幾年，以及在修法過程中必然碰到的難題。這次疫情為本澳航空運輸發展爭取寶貴的時間，希望政府及各界人士為疫後澳門及灣區航空業務擴展共同努力。
去年九月二十三日起，全國居民赴澳自由行簽註全部恢復，意味澳門向內地重新開通，客流逐步回升；加上港澳政策分開，體現出政策決心比較大，且澳門防控跟內地嚴謹的防控程度基本上一樣。在去年第四季度，澳航的內地航線客流同比由剛開始恢復兩成，再回升至到三成、四成。踏入二○二一年後，澳航陸續開設或恢復了多條內地航線：一月十九日開設澳門至浙江義烏航線，每周三個往返航班；二月二日重開澳門至安徽合肥航線，每周三個往返航班。二月三日起，青島往返澳門航線亦將會復航。為慶祝青島澳門航線復航，澳門航空還特別推出機票特惠活動；內地往返澳門機票買一送一，同行第三人也可享五折優惠，酒店價格則低至五折。
防疫期間，機場專營公司（CAM）要求各個業務部門視國際市場的恢復情況制定復甦預案，重點推出對航空、海運、跨境陸路巴士等交通網絡上的優惠措施。CAM又要求機場各個相關單位繼續遵循政府防疫抗疫工作指引，做好機場防疫措施，堵塞防疫漏洞，全面落實「安全、效率、效益」的公司宗旨，做好復航的准備工作，特別是改善門戶機場的旅客服務態度，提升業務工作水平，提升安保工作的效率和質素；確保分營商向航空公司和貨運商提供安全、快速、便利的優質服務。澳門航空從去年九月三十日起進一步增加整體航班投入數量，每週投入內地航班二百三十個班次，陸續增加了不少內地航點，並加密北京上海等地的航班。民航旅遊業人士建議，政府和業界應加快旅遊資源整合，擴大區域合作，助力區域旅遊氣泡；仿效當年汶川大地震後「關愛四川」的模式，補貼澳門居民經由澳門機場飛往國內出遊。這樣既可協助出境遊旅行社及從業員，又可雙向客流拉動航空業恢復。